Sông Đà và sông Mã là 2 sông chính chảy qua địa bàn tỉnh ta, có tổng chiều dài đường thủy 360km, với 3 bến cảng, 15 bến chợ và 69 bến đò ngang sông trải dài 8 huyện dọc sông đang hoạt động.

Hoạt động dịch vụ vận tải hành khách đường sông trên sông Đà thuộc địa bàn xã Tạ Khoa (Bắc Yên).

Thời gian tới, cùng với việc tăng cường phối hợp tuần tra, kiểm soát vi phạm an toàn giao thông đường thủy nội địa, Sở giao thông vận tải tiếp tục phối hợp với UBND các huyện, xã tăng cường công tác tuyên truyền bằng nhiều hình thức đa dạng, phong phú; tổ chức đăng ký, đăng kiểm, đào tạo tại cơ sở. Đồng thời, giao chính quyền cấp cơ sở tổ chức kiểm tra các cơ sở đóng mới phương tiện thủy, cấp phép cho các cơ sở đảm bảo đủ năng lực. Công bố rộng rãi, cấp miễn phí mẫu định hình đã được Cục đăng kiểm Việt Nam phê duyệt, tạo điều kiện cho nhân dân lựa chọn để đóng mới tàu, thuyền phù hợp; hoàn thành dự thảo phân cấp quản lý giao thông đường thủy nội địa trình UBND tỉnh làm cơ sở pháp lý, nâng cao công tác quản lý.