Trên địa bàn toàn tỉnh hiện có 32 cơ sở chế biến nông sản, tập trung chủ yếu ở khu vực Mai Sơn, Mộc Châu, Thành phố. Chế biến các sản phẩm chủ yếu, gồm: Cà phê, chè, tinh bột sắn, đường, sữa và các loại hoa quả.

Ca sản xuất tại Công ty cổ phần chế biến nông sản BHL Sơn La.

Năm 2021, tỉnh đã thu hút đầu tư thêm Dự án tổ hợp trang trại sinh thái, bò sữa công nghệ cao Mộc Châu, với quy mô 4.000 con bò sữa, đáp ứng sản xuất khoảng 20 triệu lít sữa bò tươi nguyên chất mỗi năm, tổng mức đầu tư hơn 1.000 tỷ đồng; Nhà máy chế biến nông sản cụm công nghiệp Mộc Châu; Nhà máy chế biến đường lỏng glucose BHL Sơn La tại Khu công nghiệp Mai Sơn, với tổng vốn đầu tư 185 tỷ đồng. Năm 2022, tỉnh ta tiếp tục đẩy mạnh công tác thu hút đầu tư, chủ động phối hợp với các bộ, ngành Trung ương khẩn trương hoàn thiện các thủ tục đầu tư và triển khai thực hiện một số dự án lớn: Đường cao tốc Sơn La - Hòa Bình, Cảng hàng không Nà Sản...